[autismo-biologia] chromosome microarray / Q&R di genetica

Dom 1 Apr 2012 15:16:15 CEST

Buongiorno,

Grazie per aver riassunto le mie risposte, vorrei 
solo aggiungere alcune precisazioni riguardo a 
quanto ho scritto nell'email precedente, sperando 
che questo possa essere utile

>"b) Non si sa di genotipi necessari e 
>sufficienti per il fenotipo autistico, infatti 
>vi sono portatori sani di geni 
>presunti autistici e persone con tratti 
>autistici senza quei particolari geni"

Non e' esattamente questo che intendevo dire. 
Infatti si conoscono gia' molti loci/geni che 
quando alterati causano il fenotipo autistico (ma 
ognuno di questi e' alterato in un piccolo numero 
di casi). In una review di Catalina Betancour ne 
sono stati contati piu' di cento, e molti altri 
devono essere ancora 
identificati...(http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0006899310025916).
Quello che intendevo dire e' che talvolta la 
situazione non sempre cosi' "bianco o nero". Ad 
esempio alcuni CNV hanno un chiaro ruolo 
patologico ma si manifestano associati a fenotipi 
piuttosto diversi tra loro.

>2. Che utilità hanno le diagnosi genetiche senza conseguenze terapeutiche?
>a) Counselling riproduttivo rispetto alla 
>ricorrenza (in media rischio del 10% variabile 
>da 1-2% a 50% a seconda dell'eziologia genetica)
b) Prevenzione delle complicazioni comunicative, 
relazionali e comportamentali 
con interventi psicoeducativi strutturati precoci

Credo che sia importante anche ribadire che la 
scoperta delle cause eziologiche e' fondamentale 
per stimolare la ricerca su nuovi target 
farmacologici piu' mirati.
E' evidente che l'eziologia dell'autismo e' 
caratterizzata da un alto grado di eterogeneità 
(tante alterazioni in geni diversi, ognuna rara), 
ma e' plausibile che i geni implicati facciano 
parte di pathways comuni. Ogni singola 
alterazione genetica  sara' quindi rara, ma 
diverse di queste potranno presumibilemtne essere 
"raggruppate" come facenti parte dello stesso 
pathway o meccanismo biologico, sul quale si 
potra' focalizzare la ricerca farmacologica.

Cordiali saluti,
Elena Maestrini

>Sperando vi sia tempo, nell'evento di Ferrara su 
>"Cos'è questa cosa chiamata autismo" citerò con 
>la fonte i Quesiti & Risposte 
>di D. Mariani-Cerati e E. Maestrini come segue:
>
>1. Qual'è il peso delle malattie monogeniche nello spettro autistico?
>
>a) le spiegazioni genetiche del fenotipo autistico comprendono
>	- circa 5% sindromi 
>note (X Fragile, mutazioni di PTEN, sindrome 
>di Rett, sclerosi tuberosa, ecc)
>	- circa 5% anomalie cromosomiche visibili citogeneticamente
>	- 
>10-20% delezioni o duplicazioni submicroscopiche 
>identificabili con i microarrays
>b) Non si sa di genotipi necessari e 
>sufficienti per il fenotipo autistico, infatti 
>vi sono portatori sani di geni 
>presunti autistici e persone con tratti 
>autistici senza quei particolari geni

>
>3. Quanto pesano mutazioni e CNV nel determinare la prevalenza di maschi?
>a) Resta ancora non spiegata la preponderanza 
>di maschi con autismo che, peraltro, non è 
>così evidente nei casi senza disabilità mentale 
>conclamata
>b) è plausibile un effetto soglia 
>rispetto all'accumulo di molteplici 
>piccole variazioni di DNA (e il cervello nel suo 
>complesso è il tavolo di negoziazione tra 
>genetica ed epigenetica fin da prima 
>della nascita)
>
>Con l'occasione esprimo riconoscenza per tutti i 
>partecipanti al forum per gli stimoli teorici e 
>pratico-politici che ci si dà reciprocamente in 
>barba alle distanze geografiche e temporali che 
>rendono impossibile dialogare in altro modo. I 
>metodi diversi rischiano di farci credere che 
>possano esistere verità diverse. Sarebbe questo 
>un errore epistemologico oscurantista come 
>avveniva ai tempi di Galileo...
>
>Stefano Palazzi
>
>
>On 31 Mar 2012, at 05:22, David Vagni wrote:
>
>>Sulla genetica (comprese le tecniche) ho 
>>recentemente fatto un'intervista al Dott. Sacco.
>>Ne approfitto per rendervi partecipi:
>>
>><http://www.spazioasperger.it/caratteristiche-dell-asperger/80-genetica-e-ambiente-i-diversi-autismi-intervista-con-roberto-sacco>http://www.spazioasperger.it/caratteristiche-dell-asperger/80-genetica-e-ambiente-i-diversi-autismi-intervista-con-roberto-sacco
>>
>>Il giorno 27/mar/2012, alle ore 14.07, Elena Maestrini ha scritto:
>>
>>>Buongiorno,
>>>
>>>Non ho visto il trafiletto su Repubblica di 
>>>cui parla, quindi non mi posso riferire al 
>>>contesto, ad ogni modo, molto brevemente:
>>>chromosome microarrays: si tratta di una 
>>>tecnica di analisi del genoma che permette di 
>>>rilevare la presenza di riarrangiamenti 
>>>(delezioni o duplicazioni,cioe' perdita a 
>>>acquisizione di tratti di DNA), di dimensioni 
>>>piu' piccole di quelle normalmente visibili 
>>>con la tradizionale analisi dei cromosomi 
>>>(carioptipo). Questo permette di evidenziare 
>>>alterazioni del DNA che potrebbero essere la 
>>>causa di una patologia, come per esempio 
>>>l'autismo, in un certo numero di casi. Tramite 
>>>il microarrays pero' nono sono rilevabili le 
>>>alterazioni della sequenza del DNA ancora piu' 
>>>piccole, quelle che interessano una o poche 
>>>basi.
>>>Cosa che invece e' possibile attraverso l'Exome sequencing
>>>Exome sequencing:  permette di determinare la 
>>>sequenza di tutte le porzioni del genoma che 
>>>codificano per proteine
>>>
>>>Spero che questo "riassunto" possa essere utile,
>>>
>>>Cordialmente,
>>>Elena Maestrini
>>>
>>>
>>>
>>>>salve
>>>>
>>>>leggo oggi, su Repubblica Salute
>>>>
>>>>un piccolo box di Paolo Cornaglia Ferraris
>>>>che cita appunto
>>>>
>>>>chromosome microarrays
>>>>e
>>>>exome sequencing
>>>>
>>>>qualcuno puo' fare un breve "riassunto"
>>>>di quel che sta dietro queste espressioni?
>>>>
>>>>grazie
>>>>
>>>>Luca Egidio
>>>>
>>>>
>>>>_______________________________________________
>>>>Lista di discussione autismo-biologia
>>>><mailto:autismo-biologia a autismo33.it>autismo-biologia a autismo33.it
>>>>Per cancellarsi dalla lista inviare un 
>>>>messaggio 
>>>>a: <mailto:valerio.mezzogori a autismo33.it>valerio.mezzogori a autismo33.it
>>>>
>>>
>>>_______________________________________________
>>>Lista di discussione autismo-biologia
>>><mailto:autismo-biologia a autismo33.it>autismo-biologia a autismo33.it
>>>Per cancellarsi dalla lista inviare un 
>>>messaggio 
>>>a: <mailto:valerio.mezzogori a autismo33.it>valerio.mezzogori a autismo33.it
>>>
>>
>>_______________________________________________
>>Lista di discussione autismo-biologia
>><mailto:autismo-biologia a autismo33.it>autismo-biologia a autismo33.it
>>Per cancellarsi dalla lista inviare un 
>>messaggio a: valerio.mezzogori a autismo33.it
>>
>
>
>_______________________________________________
>Lista di discussione autismo-biologia
>autismo-biologia a autismo33.it
>Per cancellarsi dalla lista inviare un messaggio 
>a: valerio.mezzogori a autismo33.it
-------------- parte successiva --------------
Un allegato HTML è stato rimosso...
URL: http://autismo33.it/mailman/private/autismo-biologia/attachments/20120401/bf27323d/attachment.htm