"A questo proposito, segnalo che alcuni mesi fa è stato pubblicato un intero numero monografico di Biological Psychiatry
Novel Neurodevelopmental Disturbances and Autism Risk [Volume 89, Issue 5, Pages A1-A10, e21-e30, 415-532 (1 March 2021).. https://www.sciencedirect.com/journal/biological-psychiatry/vol/89/issue/5
] che mostra molto chiaramente che più che di genetica si dovrebbe
parlare (anche in questo ambito) di EPIGENETICA: cioè di alterazioni
(dis-reattive) precoci (prime fasi dello sviluppo embrio-fetale ma in
parte connesse ad alterazioni genomiche nei gameti in particolare
paterni: CNVs ecc. ) dell’espressione genica a carico di specifici geni
fondamentali nella modulazione della differenziazione neuronale (in
specifiche aree del cervello: in questo caso essenzialmente aree
frontali/prefrontali).. l’intero numero monografico è di grande rilievo e
non può che essere interpretato in questo senso.
In particolare: Adhya D, Swarup V, Nagy R, et al. Atypical Neurogenesis in Induced Pluripotent Stem Cells From Autistic Individuals. Biol Psychiatry. 2021;89(5):486-496. doi:10.1016/j.biopsych.2020.06.014
nel
quale si mostra chiaramente come le iPSC di soggetti autistici mostrino
una neurogenesi atipica rispetto alle iPSC di controllo. Nello
specifico, gli autori hanno osservato differenze nell'organizzazione
delle cellule neurali e nella velocità di differenziazione/commitment
(ma solo quando le cellule erano destinate a diventare neuroni
corticali). Questi risultati suggeriscono che le differenze cellulari
associate all'autismo emergano durante il primo sviluppo prenatale,
facendo progredire la comprensione delle origini dell'autismo.
Provo a riassumerne alcuni punti essenziali
L'autismo è un insieme eterogeneo di disturbi con un complesso fondamento molecolare. Prove da studi sul cervello post mortem
hanno indicato che lo sviluppo prenatale precoce può essere alterato
nell'autismo. Le cellule staminali pluripotenti indotte (iPSC) generate
da individui con autismo con macrocefalia indicano anche lo sviluppo
prenatale come un periodo critico per questa condizione.
Ma poco si sa sugli eventi cellulari alterati precoci durante le fasi prenatali dell'autismo…. Prove crescenti indicano che la perturbazione durante i periodi critici dello sviluppo prenatale può essere la chiave per l'emergere dell'autismo
D. Schubert, G.J. Martens, S.M. Kolk Molecular
underpinnings of prefrontal cortex development in rodents provide
insights into the etiology of neurodevelopmental disorders Mol Psychiatry, 20 (2015), pp. 795-809
Coerentemente con questa idea, gli
studi sul cervello post-mortem sull'autismo hanno identificato la
disregolazione di presunti percorsi di espressione genica prenatale Pertanto, lo sviluppo prenatale precoce può essere un periodo critico per l'emergere della fisiopatologia cellulare associata all'autismo
N.N. Parikshak, R. Luo, A. Zhang, H. Won, J.K. Lowe, V. Chandran, et al. Integrative functional genomic analyses implicate specific molecular pathways and circuits in autism Cell, 155 (2013), pp. 1008-1021
L'uso di cellule staminali pluripotenti indotte (iPSC) permette di studiare il comportamento cellulare prenatale nell'autismo
S. Fedele, G. Collo, K. Behr, J. Bischofberger, S. Muller, T. Kunath, et al. Expansion
of human midbrain floor plate progenitors from induced pluripotent stem
cells increases dopaminergic neuron differentiation potential Sci Rep, 7 (2017), p. 6036
Kriks, J.W. Shim, J. Piao, Y.M. Ganat, D.R. Wakeman, Z. Xie, et al. Dopamine neurons derived from human ES cells efficiently engraft in animal models of Parkinson's disease Nature, 480 (2011), pp. 547-551
S.P. Pasca, T. Portmann, I. Voineagu, M. Yazawa, A. Shcheglovitov, A.M. Pasca, et al. Using iPSC-derived neurons to uncover cellular phenotypes associated with Timothy syndrome Nat Med, 17 (2011), pp. 1657-1662
Shi, P. Kirwan, F.J. Livesey Directed differentiation of human pluripotent stem cells to cerebral cortex neurons and neural networks Nat Protoc, 7 (2012), pp. 1836-1846
M.A. Lancaster, M. Renner, C.A. Martin, D. Wenzel, L.S. Bicknell, M.E. Hurles, et al. Cerebral organoids model human brain development and microcephaly Nature, 501 (2013), pp. 373-379
(molti)
studi evidenziano che i fenotipi cellulari e molecolari associati
all'autismo possono iniziare durante lo sviluppo cerebrale prenatale.
Un aspetto critico di questi studi è che la differenziazione neurale atipica è associata a una maggiore proliferazione cellulare. Tuttavia, poiché i partecipanti autistici a questi studi avevano anche macrocefalia, non è chiaro se lo sviluppo anormale osservato fosse in parte dovuto a questa comorbidità. Inoltre, poiché la
macrocefalia è presente solo in un sottoinsieme di individui con
autismo, non è noto se lo sviluppo atipico possa essere generalizzato a
individui autistici senza macrocefalia. Infine, poiché la
maggior parte degli studi si è concentrata principalmente sullo
sviluppo dei neuroni proencefalo/corticali, è ancora da verificare se lo
sviluppo atipico può essere osservato anche nei precursori neurali
corticali destinati a un lignaggio diverso.
In questo studio, abbiamo
quindi generato iPSC da individui autistici senza macrocefalia da 3
coorti di partecipanti indipendenti per esaminare una popolazione più
ampia di individui con autismo.
Gli studi iniziali sul sequenziamento dell'RNA hanno indicato che lo sviluppo neurologico precoce può essere influenzato. Per indagare
ulteriormente sulla fonte dell'espressione genica atipica, abbiamo
intrapreso ampi esperimenti di fenotipizzazione cellulare.
Firme dell'espressione genica dello sviluppo neurologico nei neuroni derivati dall'autismo-iPSC
Le cellule iPSC sono state generate da 9 individui con autismo e 6 individui di controllo tipici da 3 coorti indipendenti..
Ci siamo concentrati su 3 distinte fasi di sviluppo
1) giorno 9, stadio precoce
dei precursori neurali, quando le cellule staminali formano nuove
cellule precursori che si auto-organizzano in strutture simili a tubi
neurali note come rosette neurali con una disposizione direzionale apicale-basale;
2) giorno 21, stadio tardivo del precursore neurale, un periodo durante il quale le
cellule progenitrici neurali iniziano a formare strati dalla superficie
apicale e sono preparate per la differenziazione in neuroni mentre si
spostano verso l'esterno; e
3) giorno 35, neuroni corticali immaturi, uno stadio in cui i precursori diventano postmitotici e adottano un'identità neuronale
L'analisi dell'espressione genica differenziale ha confermato profili trascrittomici distinti di iPSC di controllo e autismo
e un elevato arricchimento per i geni identificati negli studi sul
cervello post-mortem dell'autismo, ma non la schizofrenia o il cancro
La divergenza dallo sviluppo tipico nell'autismo si verifica negli stadi precoci della differenziazione corticale
Innanzitutto, abbiamo valutato l'espressione di PAX6 e Tuj1 in iPSC di controllo e autismo (Sia PAX6 che Tuj1 sono marcatori dei precursori neuronali.
M.J. Ziller, R. Edri, Y. Yaffe, J. Donaghey, R. Pop, W. Mallard, et al. Dissecting neural differentiation regulatory networks through epigenetic footprinting Nature, 518 (2015), pp. 355-359
M.A. Tischfield, H.N. Baris, C. Wu, G. Rudolph, L. Van Maldergem, W. He, et al. Human TUBB3 mutations perturb microtubule dynamics, kinesin interactions, and axon guidance Cell, 140 (2010), pp. 74-87
…… i precursori derivati dal controllo-iPSC hanno espresso PAX6 e Tuj1 all'inizio della differenziazione, mentre le iPSC autistiche hanno mostrato un'espressione PAX6 e Tuj1 inferiore nella fase equivalente.
Dopo questa fase iniziale, il tasso di espressione di PAX6 e Tuj1 era più alto nelle iPSC con autismo e la differenza tra iPSC di controllo e iPSC era sostanzialmente ridotta al giorno 21.
Sviluppo alterato di lignaggi precursori del proencefalo in autismo-iPSCs indipendente dalla proliferazione cellulare
Precedenti studi iPSC hanno collegato uno squilibrio nelle cellule progenitrici GABA (acido gamma-aminobutirrico)-glutamatergico e nella funzione neuronale con un fenotipo di proliferazione cellulare associato alla macrocefalia. Pertanto,
eravamo interessati a stabilire se uno squilibrio simile in presenza di
cellule progenitrici GABA-glutamatergiche potesse essere osservato
nelle nostre iPSC autistiche.
Abbiamo quindi studiato lo
sviluppo di precursori che esprimono EMX1, noto per essere espresso nei
neuroni e precursori del proencefalo dorsale (glutamatergico) e GAD67,
l'enzima limitante della velocità nella via di sintesi del GABA e noto
per essere espresso in cellule GABAergiche.
- Al giorno 9, l'espressione di EMX1 era significativamente più alta nel controllo rispetto ai precursori neurali dell'autismo
- Al giorno 21,
l'espressione di EMX1 in entrambi i gruppi sembrava rimanere stabile,
con solo una riduzione minore dei precursori di controllo (dCTA = -41
cellule/giorno), al contrario di un aumento minore (dCTA = +10
cellule/giorno) nel gruppo autistico. In questa fase, i progenitori neurali di controllo hanno espresso EMX1 significativamente più alto dei progenitori neurali dell'autismo
- Nei neuroni immaturi del
giorno 35, l'espressione di EMX1 sia nei neuroni di controllo che in
quelli autistici era ridotta rispetto all'espressione nei precursori del
giorno 9 e -21; tuttavia, la riduzione era significativamente più acuta nel gruppo con autismo (
L'espressione di GAD67 nelle iPSC autistiche e di controllo ha seguito una traiettoria opposta.
- Al giorno 9,
l'espressione di GAD67 era significativamente più alta nei precursori di
controllo, mentre i precursori dell'autismo mostravano un'espressione
trascurabile
- Al giorno 21, l'espressione di
GAD67 era ridotta nei progenitori di controllo (dCTA = -68
cellule/giorno) ma era significativamente aumentata nei progenitori
neurali dell'autismo (dCTA = +185 cellule/giorno) ... I progenitori del
controllo e dell'autismo avevano un'espressione GAD67 simile in questa
fase
- Tuttavia, al giorno 35, l'espressione di GAD67 nei neuroni autistici era superiore a quella nei neuroni di controllo .. Similmente
a quello che abbiamo osservato con le cellule che esprimono PAX6 e
Tuj1, anche l'espressione di EMX1 e GAD67 ha mostrato una notevole
variabilità. Di nuovo, l'analisi della varianza ha rivelato una maggiore variabilità nella maggior parte dei parametri nelle linee di autismo..
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IN SINTESI
In questo studio, abbiamo utilizzato iPSC generati da coorti indipendenti e da individui con autismo ma senza macrocefalia…
e abbiamo accertato che la differenziazione delle iPSC autistiche verso
un destino corticale, ma non mesencefalico, determina una neurogenesi
atipica caratterizzata da maturazione prematura e specificazione
anormale delle cellule progenitrici neurali. Questi effetti si verificano in assenza di attività proliferativa alterata tra iPSC di controllo e autismo. L'identificazione di questi fenotipi cellulari/molecolari ci ha permesso di trovare percorsi cellulari comuni in una coorte con background genetico eterogeneo.